🎓 Complete the presentation?

.idea/inspectionProfiles/Project_Default.xml

@@ -1,6 +1,7 @@
 <component name="InspectionProjectProfileManager">
   <profile version="1.0">
     <option name="myName" value="Project Default" />
+    <inspection_tool class="BibtexUnusedEntry" enabled="false" level="WARNING" enabled_by_default="false" />
     <inspection_tool class="CssUnresolvedCustomProperty" enabled="false" level="ERROR" enabled_by_default="false" />
     <inspection_tool class="DuplicatedCode" enabled="false" level="WEAK WARNING" enabled_by_default="false" />
     <inspection_tool class="ES6ConvertVarToLetConst" enabled="false" level="WEAK WARNING" enabled_by_default="false" />

thesis/source/conf.py

@@ -164,3 +164,4 @@ todo_link_only = False
 bibtex_bibfiles = [
     "refs.bib",
 ]
+bibtex_reference_style = "super"

thesis/source/docs/3_presentazione/index.rst

@@ -5,20 +5,27 @@
 Presentazione
 *************
 
-.. todo::
+Nelle scienze, sia teoriche, sia sperimentali, si verifica spesso la necessità di dover prendere appunti e condividere appunti sulla ricerca effettuata.
 
-   Scrivere questa sezione.
+Mentre in passato a tale scopo venivano utilizzati quaderni di carta (detti anche *"blocchi note laboratoriali"* :cite:`enwiki:993314047`), con la nascita dell'informatica si iniziarono ad utilizzare strumenti digitali, più comodi ed efficienti: inizialmente, semplici word processor come *Microsoft Word*, arrivando poi negli ultimi anni ai più avanzati e interattivi `notebook computazionali <Notebook computazionali>`.
 
 
 .. index::
-   single: notebook computazionali
+   single: notebook computazionale
+   single: celle
 
 Notebook computazionali
 =======================
 
-.. todo::
+I *notebook computazionali* sono documenti interattivi frequentemente utilizzati nel mondo della ricerca, in quanto permettono di documentare l'analisi di dati con feedback grafico immediato.
 
-   Scrivere questa sezione.
+Tipicamente, sono composti da tante **celle** contenenti codice in un qualche linguaggio di programmazione, le quali sono eseguite e il cui output è  mostrato all'utente sotto forma di testo, equazioni, immagini, grafici, o anche widget interattivi come slider o aree di input testo.
+
+Alcuni esempi di software per la scrittura di notebook computazionali sono `Jupyter`, `Wolfram Mathematica <https://www.wolfram.com/mathematica/>`_, `MATLAB Live Editor <https://it.mathworks.com/products/matlab/live-editor.html>`_...
+
+.. figure:: hist_example.png
+
+   Un esempio di notebook `Jupyter` con una cella di testo e una cella di Python che emette un grafico. :cite:`matplotlib:histograms`
 
 
 .. index::
@@ -29,43 +36,29 @@ Jupyter
 
 *Jupyter* è un'applicazione che permette la scrittura e la visualizzazione di `notebook computazionali <Notebook computazionali>`.
 
-È composta da (almeno) 3 parti:
+È composta da 3 (o più) parti:
 
 .. index::
    single: Jupyter; kernel
-
--  un **kernel** per ogni linguaggio di programmazione che si desidera utilizzare nel notebook;
-
-   .. note::
-
-      .. index::
-
    single: IPython
 
-      Ad esempio, `IPython <https://ipython.org/>`_ è un kernel Jupyter per il linguaggio di programmazione `Python <https://www.python.org/>`_.
+-  | Un **kernel** per il linguaggio di programmazione che si desidera utilizzare nel notebook (o, se si desidera più linguaggi, un kernel per ciascun linguaggio).
+   | Il kernel si occupa di eseguire su richiesta le celle del notebook, e di rispondere alla richiesta con i risultati dell'esecuzione.
+   | Il kernel predefinito di Jupyter è `IPython <https://ipython.org/>`_, che permette di utilizzare il linguaggio di programmazione `Python <https://www.python.org/>`_.
 
 .. index::
    single: Jupyter; server
 
--  un **server** che gestisce le richieste dell'utente di modifica del notebook, salvandole sul file system, e di valutazione celle, inoltrando la richiesta al kernel corrispondente;
-
-   .. note::
-
-      Attualmente, l'unico server Jupyter esistente è `Jupyter Server <https://github.com/jupyter-server/jupyter_server>`_.
+-  | Un **server** che gestisce le richieste dell'utente di interazione con il notebook, inoltrandole a un kernel se necessario.
+   | Il server ufficiale di Jupyter è `Jupyter Server <https://github.com/jupyter-server/jupyter_server>`_.
 
 .. index::
    single: Jupyter; client
-
--  un **client** che mostra in un formato user-friendly il contenuto del notebook e gli permette di modificarlo con facilità, connettendosi al relativo server.
-
-   .. note::
-
-      .. index::
-
    single: Jupyter; Notebook
    single: Jupyter; Lab
 
-      Esistono due client per Jupyter: il client di vecchia generazione `Jupyter Notebook <https://github.com/jupyter/notebook>`_ e il client di nuova generazione `JupyterLab <https://github.com/jupyterlab>`_.
+-  | un **client** che mostra in un formato user-friendly il contenuto del notebook e gli permette di modificarlo con facilità, connettendosi al relativo server.
+   | Esistono due client ufficiali per Jupyter: il client di vecchia generazione `Jupyter Notebook <https://github.com/jupyter/notebook>`_ e il client di nuova generazione `JupyterLab <https://github.com/jupyterlab>`_.
 
 
 .. index::
@@ -74,7 +67,8 @@ Jupyter
 Hosting di Jupyter
 ==================
 
-È possibile effettuare l'hosting di `Jupyter` in vari modi, in base a come esso verrà utilizzato.
+È possibile utilizzare `Jupyter` in diversi modi, ciascuno con alcuni vantaggi e svantaggi.
+
 
 .. index::
    single: Jupyter; hosting locale
@@ -86,11 +80,9 @@ Hosting locale
 
 Così facendo, le celle verranno eseguite con le risorse del proprio computer, e il notebook sarà accessibile solo dal computer che sta eseguendo il server.
 
-È il modo più facile per usare Jupyter, ma rende impossibile la collaborazione e rende impossibile eseguire alcune operazioni, in quanto le risorse del proprio computer potrebbero non essere sufficienti.
+È un ottimo modo per lavorare su progetti personali, in quanto offre la massima personalizzazione dell'ambiente, e per lavorare offline, in quanto è in grado di funzionare senza alcuna connessione ad Internet.
 
-.. todo::
-
-   Rivedere vantaggi e svantaggi.
+In base al proprio sistema operativo, però, potrebbe risultare difficile da installare, e in base alla propria configurazione di rete, collaborare su un progetto potrebbe essere impossibile (senza appoggiarsi a strumenti esterni di scambio file, come email, o sistemi di controllo versione).
 
 
 .. index::
@@ -105,11 +97,9 @@ Come software-as-a-service
 
 Alcuni esempi di cloud provider che forniscono questo servizio sono Google, con `Google Colaboratory <https://colab.research.google.com/#>`_ e Amazon, con `SageMaker Notebook <https://docs.aws.amazon.com/sagemaker/latest/dg/nbi.html>`_.
 
-Entrambe le opzioni sono un ottimo modo per utilizzare Jupyter, anche in collaborazione con più persone, ma hanno il difetto di essere costose o poco personalizzabili.
+Generalmente, il modello software-as-a-service è il modo più semplice per usare Jupyter, in quanto non richiede di effettuare alcuna installazione sul proprio computer, e in genere permette la collaborazione online con altri utenti.
 
-.. todo::
-
-   Rivedere vantaggi e svantaggi.
+Purtroppo, però, offre poche opzioni per personalizzare l'ambiente, e, se si necessitano più risorse di quelle offerte gratuitamente dai provider, il costo cresce molto rapidamente.
 
 
 .. index::
@@ -119,12 +109,10 @@ Entrambe le opzioni sono un ottimo modo per utilizzare Jupyter, anche in collabo
 Hosting on-premises
 -------------------
 
-È possibile configurare un server della propria istituzione in modo tale che ospiti uno o più server Jupyter a cui si connetteranno i suoi utenti.
+È possibile configurare un server della propria istituzione in modo tale che esegua uno o più server Jupyter a cui si connetteranno gli utenti.
 
-A tale scopo, è disponibile il progetto `JupyterHub <https://jupyter.org/hub>`_, in grado di gestire oltre centinaia di utenti e notebook.
+A tale scopo, è disponibile il progetto `JupyterHub <https://jupyter.org/hub>`_, in grado di gestire migliaia di utenti simultanei :cite:`jupyter:ifaq`, ciascuno con il proprio notebook.
 
-È complesso da installare, ma performante ed efficace; è però molto essenziale, in quanto è un progetto parecchio recente, e carente in certe funzionalità, come collaborazione simultanea e autenticazione esterna.
+È performante ed efficace, e lascia completa libertà agli utenti di personalizzare il loro ambiente di lavoro.
 
-.. todo::
-
-   Rivedere vantaggi e svantaggi.
+L'interfaccia di gestione utenti e notebook è però ancora molto essenziale, essendo un progetto piuttosto nuovo, e non supporta nativamente la collaborazione multiutente su un singolo notebook, preferendo il modello *"tanti server Jupyter da utente singolo"* :cite:`jupyter:hub`.

thesis/source/docs/9_appendice/index.rst

@@ -1,3 +1,14 @@
 *********
 Appendice
 *********
+
+.. only:: html
+
+   .. rubric:: Bibliografia
+
+.. todo::
+
+   Capire perchè i label della bibliografia vengono ignorati.
+
+.. bibliography::
+   :all:

thesis/source/index.rst

@@ -10,12 +10,14 @@ Progettazione e sviluppo di Sophon, applicativo cloud a supporto della ricerca
    docs/1_sinossi/index
    docs/2_introduzione/index
    docs/3_presentazione/index
+
+   docs/9_appendice/index
+
 .. docs/4_requisiti/index
 .. docs/5_progetto/index
 .. docs/6_implementazione/index
 .. docs/7_applicazione/index
 .. docs/8_conclusione/index
-.. docs/9_appendice/index
 
 .. only:: html
 

thesis/source/refs.bib

@@ -0,0 +1,32 @@
+@misc{
+matplotlib:histograms,
+    author = {Matplotlib},
+    title = {Histograms},
+    howpublished = {https://web.archive.org/web/20210815080710/https://matplotlib.org/stable/gallery/statistics/hist.html},
+    note = {Accessed: 2021-11-15},
+}
+
+@misc{
+jupyter:ifaq,
+    author = {Project Jupyter},
+    title = {Institutional FAQ},
+    howpublished = {https://web.archive.org/web/20200317115530/https://jupyterhub.readthedocs.io/en/stable/getting-started/institutional-faq.html},
+    note = {Accessed: 2021-11-15},
+}
+
+@misc{
+jupyter:hub,
+    author = {Project Jupyter},
+    title = {JupyterHub},
+    howpublished = {https://jupyterhub.readthedocs.io/en/stable/},
+    note = {value},
+}
+
+@misc{
+enwiki:993314047,
+    author = {Wikipedia},
+    title = {Electronic lab notebook --- {Wikipedia}{,} The Free Encyclopedia},
+    year = {2020},
+    howpublished = {https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Electronic_lab_notebook&oldid=993314047},
+    note = {Accessed 2021-11-15},
+}