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Steffo 2021-11-03 15:25:47 +01:00
parent 92e207f956
commit defca6dff5
18 changed files with 478 additions and 65 deletions

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@ -37,19 +37,19 @@ services:
environment: environment:
# INSTALL: Set a random secret key! # INSTALL: Set a random secret key!
- DJANGO_SECRET_KEY=change-me!!! - DJANGO_SECRET_KEY=change-me!!!
# INSTALL: Configure your proxy details!
- DJANGO_PROXY_BASE_DOMAIN=dev.sophon.steffo.eu
- DJANGO_PROXY_PROTOCOL=http
# INSTALL: Configure your allowed hosts! # INSTALL: Configure your allowed hosts!
- DJANGO_ALLOWED_HOSTS=api.dev.sophon.steffo.eu - DJANGO_ALLOWED_HOSTS=api.dev.sophon.steffo.eu
# INSTALL: Configure your allowed origins! (* doesn't work) # INSTALL: Configure your allowed origins! (* doesn't work)
- DJANGO_ALLOWED_ORIGINS=http://dev.sophon.steffo.eu - DJANGO_ALLOWED_ORIGINS=http://dev.sophon.steffo.eu
# INSTALL: Configure your proxy details!
- DJANGO_PROXY_BASE_DOMAIN=dev.sophon.steffo.eu
- DJANGO_PROXY_PROTOCOL=http
# INSTALL: Configure your static url! # INSTALL: Configure your static url!
- DJANGO_STATIC_URL=http://static.dev.sophon.steffo.eu/django-static/ - DJANGO_STATIC_URL=http://static.dev.sophon.steffo.eu/django-static/
# INSTALL: Set your language! # INSTALL: Set your language!
- DJANGO_LANGUAGE_CODE=en-us - DJANGO_LANGUAGE_CODE=en-us
# INSTALL: Set your timezone! # INSTALL: Set your timezone!
- DJANGO_TIME_ZONE=CET - DJANGO_TIME_ZONE=Europe/Rome
# INSTALL: Set the superuser login details! # INSTALL: Set the superuser login details!
- DJANGO_SU_USERNAME=root - DJANGO_SU_USERNAME=root
- DJANGO_SU_EMAIL=root@example.org - DJANGO_SU_EMAIL=root@example.org
@ -80,7 +80,6 @@ services:
proxy: proxy:
image: ghcr.io/steffo99/sophon-proxy:latest image: ghcr.io/steffo99/sophon-proxy:latest
ports: ports:
# INSTALL: Change this port based on your own needs!
- "30033:80" - "30033:80"
environment: environment:
# INSTALL: Configure your proxy details! # INSTALL: Configure your proxy details!

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@ -27,6 +27,10 @@ Qualsiasi **membro** di un :ref:`gruppo di ricerca` può creare nuovi notebook a
.. image:: creation.png .. image:: creation.png
.. note::
Per motivi tecnici, i notebook non possono avere come slug ``backend``, ``frontend``, ``proxy``, ``api``, ``static`` e ``src``.
Stato del notebook Stato del notebook
------------------ ------------------

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@ -3,13 +3,13 @@ I concetti
Questa sezione illustra i concetti chiave di Sophon e il loro funzionamento. Questa sezione illustra i concetti chiave di Sophon e il loro funzionamento.
.. image:: diagram_full.png
.. toctree:: .. toctree::
:maxdepth: 3 :maxdepth: 1
1_instances/index 1_instances/index
2_users/index 2_users/index
3_researchgroups/index 3_researchgroups/index
4_researchprojects/index 4_researchprojects/index
5_notebooks/index 5_notebooks/index
.. image:: diagram_full.png

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@ -0,0 +1,21 @@
Requisiti dell'host
===================
- Una connessione ad Internet (solo in fase di installazione)
- `GNU Wget`_ (solo in fase di installazione)
- Un nome di dominio
- Un webserver (ad esempio, `Apache HTTPd`_)
- Un certificato SSL valido *(opzionale, ma raccomandato)*
- `Docker Engine`_
- `Docker Compose`_
.. hint::
È possibile ottenere gratuitamente un certificato SSL utilizzando `Letsencrypt`_!
.. _GNU Wget: https://www.gnu.org/software/wget/
.. _Apache HTTPd: https://httpd.apache.org/
.. _Docker Engine: https://docs.docker.com/engine/
.. _Docker Compose: https://docs.docker.com/compose/
.. _Letsencrypt: https://letsencrypt.org/

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@ -0,0 +1,30 @@
Preparazione di Docker Compose
==============================
Come ``root``, si crei una nuova cartella sul proprio sistema operativo in cui archiviare le risorse relative a Sophon:
.. code-block:: console
root:~# mkdir -p /dock/sophon
Successivamente, si scarichi il file ``docker-compose.yml`` all'interno della cartella dal repository di Sophon:
.. code-block:: console
root:~# cd /dock/sophon
root:/dock/sophon# wget "https://raw.githubusercontent.com/Steffo99/sophon/main/docker-compose.yml"
--2021-11-02 18:03:05-- https://raw.githubusercontent.com/Steffo99/sophon/main/docker-compose.yml
SSL_INIT
Loaded CA certificate '/etc/ssl/certs/ca-certificates.crt'
Resolving raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com)... 185.199.108.133,
185.199.109.133, 185.199.110.133, ...
Connecting to raw.githubusercontent.com (raw.githubusercontent.com) 185.199.108.133:443...
connected.
HTTP request sent, awaiting response... 200 OK
Length: 2957 (2.9K) [text/plain]
Saving to: docker-compose.yml
docker-compose.yml 100%[===================>] 2.89K --.-KB/s in 0s
2021-11-02 18:03:05 (48.0 MB/s) - docker-compose.yml saved [2957/2957]

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@ -0,0 +1,17 @@
Configurazione DNS
==================
Si scelga il dominio (o sottodominio) sul quale si vuole che Sophon sia accessibile e si aggiungano i seguenti record DNS, sostituendo il dominio scelto a ``DOMINIO`` e gli indirizzi IPv4 e IPv6 del server al posto di `0.0.0.0` e `1234::1234`:
.. code-block:: dns
*.DOMINIO 1800 IN A 0.0.0.0
*.DOMINIO 1800 IN AAAA 1234::1234
DOMINIO 1800 IN A 0.0.0.0
DOMINIO 1800 IN AAAA 1234::1234
Sophon sarà accessibile ai seguenti indirizzi:
- l'interfaccia web a ``https://DOMINIO/``;
- l'API a ``https://api.DOMINIO/``;
- i notebook a ``https://SLUG.DOMINIO/``.

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@ -0,0 +1,214 @@
Configurazione ``docker-compose.yml``
=====================================
Si configuri con l'editor di testo preferito il file ``docker-compose.yml`` con le impostazioni desiderate.
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# open docker-compose.yml
In particolare, tutte le impostazioni precedute da ``# INSTALL`` vanno obbligatoriamente modificate.
``DJANGO_SECRET_KEY``
---------------------
Specifica la chiave segreta da usare per i cookie di sessione.
.. code-block:: yml
- DJANGO_SECRET_KEY=do-not-use-this-key-in-production-or-you-will-get-hacked
.. tip::
Un modo facile per impostare la chiave è premere velocemente tasti a caso sulla tastiera!
.. note::
Cambiare la chiave segreta una volta installato Sophon invaliderà tutti gli accessi effettuati dagli utenti.
.. warning::
La chiave segreta è un dato estremamente riservato: chiunque sia a conoscenza della chiave segreta potrà effettuare l'accesso come qualsiasi utente!
.. seealso::
`SECRET_KEY <https://docs.djangoproject.com/en/3.2/ref/settings/#std:setting-SECRET_KEY>`_ nella documentazione di Django.
``DJANGO_PROXY_BASE_DOMAIN``
----------------------------
Specifica il dominio che dovrà essere usato come radice per il proxy, ovvero il ``DOMINIO`` per il quale si è configurato il DNS in precedenza.
.. code-block:: yml
- DJANGO_PROXY_BASE_DOMAIN=prod.sophon.steffo.eu
.. note::
Se non è specificato, Sophon verrà eseguito in modalità "sviluppo", e assegnerà porte libere del server ai :ref:`notebook` invece che sottodomini.
.. seealso::
L'opzione :ref:`\`\`APACHE_PROXY_BASE_DOMAIN\`\`` più avanti in questa guida, che deve coincidere con questo valore.
``DJANGO_PROXY_PROTOCOL``
-------------------------
Specifica il protocollo che dovrà essere usato nei mapping del proxy.
Si consiglia caldamente di utilizzare ``https``, ma è un valore valido anche ``http``.
.. code-block:: yml
- DJANGO_PROXY_PROTOCOL=https
``DJANGO_ALLOWED_HOSTS``
------------------------
Specifica i domini da cui possono provenire le richieste alla pagina di amministrazione.
Per specificare più domini, è necessario separarli con dei pipe ``|`` .
Eccetto in configurazioni speciali, deve essere uguale a ``api.DOMINIO``.
.. code-block:: yml
- DJANGO_ALLOWED_HOSTS=api.prod.sophon.steffo.eu
.. seealso::
`ALLOWED_HOSTS <https://docs.djangoproject.com/en/3.2/ref/settings/#allowed-hosts>`_ nella documentazione di Django
``DJANGO_ALLOWED_ORIGINS``
--------------------------
Specifica i domini da cui possono provenire le richieste all'API.
Per specificare più domini, è necessario separarli con dei pipe ``|`` .
Eccetto in configurazioni speciali, deve essere uguale a ``PROTOCOLLO://DOMINIO|https://sophon.steffo.eu``.
.. code-block:: yml
- DJANGO_ALLOWED_ORIGINS=https://prod.sophon.steffo.eu|https://sophon.steffo.eu
.. seealso::
`Access-Control-Allow-Origin <https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/HTTP/Headers/Access-Control-Allow-Origin>`_ su MDN
``DJANGO_STATIC_URL``
---------------------
Specifica l'URL a cui saranno accessibili i file statici di Sophon.
Eccetto in configurazioni speciali, deve essere uguale a ``PROTOCOLLO://static.DOMINIO/django-static/``.
.. code-block:: yml
- DJANGO_ALLOWED_ORIGINS=http://static.prod.sophon.steffo.eu/django-static/
.. warning::
Ci si assicuri di inserire la barra finale, altrimenti Sophon non funzionerà correttamente!
.. seealso::
`STATIC_URL <https://docs.djangoproject.com/en/3.2/ref/settings/#std:setting-STATIC_URL>`_ nella documentazione di Django
``DJANGO_LANGUAGE_CODE``
------------------------
Specifica la lingua che deve usare Sophon nei messaggi di errore.
Usa il formato `language code`_ di Django.
.. code-block:: yml
- DJANGO_LANGUAGE_CODE=en-us
.. tip::
Generalmente è una buona idea impostarlo a ``en-us`` per facilitare la risoluzione di eventuali problemi.
.. seealso::
`LANGUAGE_CODE <https://docs.djangoproject.com/en/3.2/ref/settings/#language-code>`_ nella documentazione di Django
.. _language code: https://docs.djangoproject.com/en/3.2/topics/i18n/#term-language-code
``DJANGO_TIME_ZONE``
--------------------
Specifica il fuso orario che deve usare Sophon nell'interfaccia di amministrazione.
Usa il formato `tzdata`_.
.. code-block:: yml
- DJANGO_TIME_ZONE=Europe/Rome
.. hint::
Il fuso orario italiano è ``Europe/Rome``.
.. _tzdata: https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_tz_database_time_zones
``DJANGO_SU_USERNAME``
----------------------
Specifica il nome del :ref:`superutente` che verrà automaticamente creato qualora il database non contenga altri utenti.
.. code-block:: yml
- DJANGO_SU_USERNAME=root
``DJANGO_SU_EMAIL``
-------------------
Specifica l'email del :ref:`superutente` che verrà automaticamente creato qualora il database non contenga altri utenti.
.. code-block:: yml
- DJANGO_SU_USERNAME=bot@steffo.eu
.. note::
Attualmente, l'email non è utilizzata, ma è richiesta da Django per la creazione di un nuovo utente.
``DJANGO_SU_PASSWORD``
----------------------
Specifica la password del :ref:`superutente` che verrà automaticamente creato qualora il database non contenga altri utenti.
.. code-block:: yml
- DJANGO_SU_PASSWORD=square
.. warning::
La password è un dato estremamente riservato, in quanto chiunque ne venga a conoscenza potrà accedere a Sophon con pieni privilegi!
``APACHE_PROXY_BASE_DOMAIN``
----------------------------
Specifica il dominio che dovrà essere usato come radice per il proxy, ovvero il ``DOMINIO`` per il quale si è configurato il DNS in precedenza.
.. code-block:: yml
- APACHE_PROXY_BASE_DOMAIN=dev.sophon.steffo.eu
.. seealso::
L'opzione :ref:`\`\`DJANGO_PROXY_BASE_DOMAIN\`\`` più indietro in questa guida, che deve coincidere con questo valore.

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@ -0,0 +1,48 @@
Download delle immagini Docker
==============================
Si utilizzi `Docker Compose`_ per scaricare le `immagini`_ Docker necessarie all'avvio di Sophon:
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# docker compose pull
[+] Running 4/4
⠿ proxy Pulled 1.5s
⠿ frontend Pulled 1.4s
⠿ db Pulled 1.9s
⠿ backend Pulled 1.6s
Inoltre, si scarichi manualmente l':ref:`immagine del Notebook` che può essere avviata da Sophon:
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# docker image pull "ghcr.io/steffo99/sophon-jupyter:latest"
latest: Pulling from steffo99/sophon-jupyter
7b1a6ab2e44d: Already exists
578d7ac380c6: Pull complete
37f1e0b584f6: Pull complete
3c7282703390: Pull complete
b38aa558f711: Pull complete
1412103d568f: Pull complete
67419a9a821e: Pull complete
37e6cc015184: Pull complete
7d9316e2b57c: Pull complete
a7f024508c72: Pull complete
f3eae3c301a1: Pull complete
d3e2107efade: Pull complete
d94bc6f8f069: Pull complete
1e1dc3e818ad: Pull complete
c975ee664182: Pull complete
101cfcc0e15b: Pull complete
bf991a0d7538: Pull complete
4c044af18c7e: Pull complete
605d8c6e8eba: Pull complete
ed06f2ae4a88: Pull complete
ed8b1c841d10: Pull complete
468fe9a390ae: Pull complete
Digest: sha256:5d42e5e40e406130c688914d6a58aa94769eab03620b53e0fd409a7fb2682a01
Status: Downloaded newer image for ghcr.io/steffo99/sophon-jupyter:latest
ghcr.io/steffo99/sophon-jupyter:latest
.. _Docker Compose: https://docs.docker.com/compose/
.. _immagini: https://docs.docker.com/engine/reference/commandline/images/

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@ -0,0 +1,22 @@
Avvio di Sophon
===============
Si utilizzi `Docker Compose`_ per eseguire le `immagini`_ di Sophon precedentemente scaricate:
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# docker compose up -d
[+] Running 4/4
⠿ Container sophon-db-1 Started 11.3s
⠿ Container sophon-frontend-1 Started 11.7s
⠿ Container sophon-backend-1 Started 10.1s
⠿ Container sophon-proxy-1 Started 11.5s
Si verifichi che i container si siano avviati correttamente con:
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# docker compose logs
.. _Docker Compose: https://docs.docker.com/compose/
.. _immagini: https://docs.docker.com/engine/reference/commandline/images/

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@ -0,0 +1,62 @@
Configurazione del webserver dell'host
======================================
Si configuri il webserver dell'host per inoltrare tutto il traffico dalla porta 443 (o 80, se si è selezionato ``http`` in :ref:`\`\`DJANGO_PROXY_PROTOCOL\`\``) alla porta locale 30033.
Sono allegate le istruzioni per il webserver `Apache HTTPd`_; possono essere però adattate se si vuole usare un webserver diverso, come `NGINX`_ o `caddy`_.
.. _Apache HTTPd: https://httpd.apache.org/
.. _nginx: https://www.nginx.com/
.. _caddy: https://caddyserver.com/
Con Apache HTTPd
----------------
Ci si assicuri che `mod_rewrite`_, `mod_proxy`_, `mod_proxy_http`_ e `mod_proxy_wstunnel`_ siano attivati.
Si aggiungano i seguenti ``VirtualHost`` alla configurazione:
.. code-block:: apacheconf
<VirtualHost *:80>
ServerName "DOMINIO"
ServerAlias "*.DOMINIO"
RewriteEngine On
RewriteRule ^(.*)$ https://%{HTTP_HOST}$1 [R=301,L]
</VirtualHost>
.. code-block:: apacheconf
<VirtualHost *:443>
ServerName "DOMINIO"
ServerAlias "*.DOMINIO"
SSLEngine on
SSLCertificateFile "/PERCORSO/ALLA/CATENA/DI/CHIAVI/PUBBLICHE/SSL"
SSLCertificateKeyFile "/PERCORSO/ALLA/CHIAVE/PRIVATA/SSL"
ProxyPreserveHost On
RequestHeader set "X-Forwarded-Proto" expr=%{REQUEST_SCHEME}
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP:Upgrade} =websocket [NC]
RewriteRule /(.*) ws://127.0.0.1:30033/$1 [P,L]
RewriteRule /(.*) http://127.0.0.1:30033/$1 [P,L]
Protocols h2 http/1.1
Header always set Strict-Transport-Security "max-age=63072000"
</VirtualHost>
Infine, si riavvii `Apache HTTPd`_:
.. code-block:: console
root:/dock/sophon# systemctl restart httpd
.. _mod_rewrite: https://httpd.apache.org/docs/2.4/mod/mod_rewrite.html
.. _mod_proxy: https://httpd.apache.org/docs/2.4/mod/mod_proxy.html
.. _mod_proxy_http: https://httpd.apache.org/docs/2.4/mod/mod_proxy_http.html
.. _mod_proxy_wstunnel: https://httpd.apache.org/docs/2.4/mod/mod_proxy_wstunnel.html

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@ -0,0 +1,4 @@
Verificare il funzionamento
===========================
Se tutto è stato configurato correttamente, l'interfaccia utente Sophon dovrebbe essere raggiungibile al ``DOMINIO`` specificato, e dovrebbe essere possibile effettuare il login con le credenziali del primo :ref:`superutente` configurate.

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@ -0,0 +1,18 @@
Installazione
*************
Questo capitolo fornisce le informazioni per l'installazione di Sophon su un server Linux.
.. toctree::
:numbered:
:maxdepth: 1
1_requirements
2_preparing_compose
3_configuring_dns
4_configuring_compose
5_pulling_images
6_starting_sophon
7_host_reverse_proxy
8_final_check

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@ -1,44 +0,0 @@
Perchè installare Sophon?
*************************
Differenze con altri progetti simili
====================================
Sophon a prima vista può sembrare simile ad altri progetti già esistenti, ma si differenzia in alcune particolarità del suo funzionamento.
Differenze con JupyterHub
-------------------------
`JupyterHub`_ è un progetto con scopi molto simili a quelli di Sophon, ovvero di permettere a tanti utenti di utilizzare `Jupyter`_ su un server remoto, ma ha funzionalità di autorizzazione molto semplici e non ha supporto per :ref:`collaborazione` in tempo reale, in quanto i server `Jupyter`_ che istanzia sono single-user.
È però più facile da scalare per grandi numeri di utenti, e ha più opzioni di deployment, a differenza di Sophon, che ne supporta una sola.
.. _JupyterHub: https://jupyter.org/hub
.. _Jupyter: https://jupyter.org/
Differenze con Google Colab
---------------------------
`Google Colab`_ è un progetto che permette di effettuare ricerca su server `Jupyter`_ utilizzando le risorse della `Google Cloud Platform`_.
A differenza di Sophon, è disponibile esclusivamente come `software-as-a-service`_, il che costringe agli utenti a trasmettere le loro informazioni ai server di Google, e non ha alcun tipo di supporto alla :ref:`collaborazione` in tempo reale.
.. _Google Colab: https://colab.research.google.com/#
.. _Google Cloud Platform: https://cloud.google.com/
.. _software-as-a-service: https://it.wikipedia.org/wiki/Software_as_a_service
Licenza FLOSS
=============
Sophon è rilasciato sotto la `GNU Affero General Public License 3`_ (o successiva).
Generalmente, significa che è possibile utilizzare il programma e modificarne il codice sorgente **liberamente**, a condizione che le modifiche effettuate vengano ritrasmesse a gli :ref:`utenti` della versione modificata nello stesso modo.
Il testo completo della licenza è disponibile all'interno del file `LICENSE.txt`_ allegato al codice sorgente del software.
.. _GNU Affero General Public License 3: https://www.gnu.org/licenses/agpl-3.0.html
.. _LICENSE.txt: https://github.com/Steffo99/sophon/blob/main/LICENSE.txt

BIN
docs/source/2_admin/2_administration/customization.png (Stored with Git LFS) Normal file

Binary file not shown.

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@ -0,0 +1,6 @@
Personalizzazione
=================
È possibile personalizzare l'istanza come descritto nella sezione :ref:`Personalizzazione dell'istanza` modificando l'unica voce del tipo **Sophon instance details** all'interno di **Sophon Core**.
.. image:: customization.png

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@ -0,0 +1,12 @@
Licenza
*******
Sophon è rilasciato sotto la `GNU Affero General Public License 3`_ (o successiva).
Il testo completo della licenza è disponibile all'interno del file `LICENSE.txt`_ allegato al codice sorgente del software.
Si specifica che la licenza copre tutti i file all'interno del repository ``Steffo99/sophon``, anche se essi non contengono un header che indica che sono protetti da copyright.
.. _GNU Affero General Public License 3: https://www.gnu.org/licenses/agpl-3.0.html
.. _LICENSE.txt: https://github.com/Steffo99/sophon/blob/main/LICENSE.txt

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@ -8,9 +8,6 @@ Benvenuto alla documentazione di Sophon, il centro di ricerca per le Università
Si è cercato di mantenere il registro di ciascuna parte al livello tecnico del pubblico a cui è destinata, pertanto è possibile osservare alcune **semplificazioni** nelle prime parti. Si è cercato di mantenere il registro di ciascuna parte al livello tecnico del pubblico a cui è destinata, pertanto è possibile osservare alcune **semplificazioni** nelle prime parti.
Tabelle dei contenuti
=====================
.. toctree:: .. toctree::
:caption: Manuale utente :caption: Manuale utente
@ -22,20 +19,20 @@ Tabelle dei contenuti
.. toctree:: .. toctree::
:caption: Guida per l'amministratore :caption: Guida per l'amministratore
2_admin/1_why_sophon 2_admin/1_installation/index
2_admin/2_how_does_it_work 2_admin/2_administration/index
2_admin/3_installation
2_admin/4_update
2_admin/5_administration
.. toctree:: .. toctree::
:caption: Documentazione tecnica :caption: Documentazione tecnica
3_dev/1_license/index
3_dev/2_differences/index
Collegamenti
============
* :ref:`genindex` Pagine speciali
* :ref:`modindex` ===============
* :ref:`search`
- :ref:`genindex`
- :ref:`modindex`
- :ref:`search`